BLASTN 2.15.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Nbe_v1.1_scf Genome Blast Database 1,666 sequences; 2,926,155,461 total letters Query= Nbe.v1.1.chr02g36650 Length=1323 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Nbe.v1.1.chr02 1755 0.0 Nbe.v1.1.chr08 1583 0.0 >Nbe.v1.1.chr02 Length=142998763 Score = 1755 bits (950), Expect = 0.0 Identities = 950/950 (100%), Gaps = 0/950 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATGAAGGCTCTGAAAAATCTGTTTCTTGGAAAATATGCATTGAAATGGAACAACAATGCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33269263 ATGAAGGCTCTGAAAAATCTGTTTCTTGGAAAATATGCATTGAAATGGAACAACAATGCC 33269204 Query 61 AAGATAGTGCCTCAATGCATGTTATCTGGACTGTCCCTTCAGTCTTGCGGCCTTGTAGGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33269203 AAGATAGTGCCTCAATGCATGTTATCTGGACTGTCCCTTCAGTCTTGCGGCCTTGTAGGA 33269144 Query 121 CCTATCCCAGAATGGATTTCTTCACAAAGAAGGATTGATTACTTGGATTTGAGTGATAAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33269143 CCTATCCCAGAATGGATTTCTTCACAAAGAAGGATTGATTACTTGGATTTGAGTGATAAG 33269084 Query 181 AAGCTCATAGGAACTTTCCCCCAGTGGCTAGCAGAAATGGAACTTGGAACTATTATTCTG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33269083 AAGCTCATAGGAACTTTCCCCCAGTGGCTAGCAGAAATGGAACTTGGAACTATTATTCTG 33269024 Query 241 TCAGATAACAATCTAACAGGTTCTCTCCTTCCTAGTCTCTTCCATTCCAGAAGTCTATCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33269023 TCAGATAACAATCTAACAGGTTCTCTCCTTCCTAGTCTCTTCCATTCCAGAAGTCTATCT 33268964 Query 301 CTTCTTGACCTTTCAAGAAACAGGTTTTCGGCGGAGCTGCCAGAAAACATGGGTAATGCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268963 CTTCTTGACCTTTCAAGAAACAGGTTTTCGGCGGAGCTGCCAGAAAACATGGGTAATGCT 33268904 Query 361 ACCGCGATTATGATTCTCATATTGGCTGAGAACAGTTGCTCTGGAAAAATTCCAAGCTCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268903 ACCGCGATTATGATTCTCATATTGGCTGAGAACAGTTGCTCTGGAAAAATTCCAAGCTCC 33268844 Query 421 ATCACCAACATTTATCGCTTGTTACTGTTGGACTTGTCAAAGAACAGACTTTCCGGCACA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268843 ATCACCAACATTTATCGCTTGTTACTGTTGGACTTGTCAAAGAACAGACTTTCCGGCACA 33268784 Query 481 ATTCCATTTTTTGATCCTACTTCTTTTGTTGCGTATGTTGACTTATCCTTTAATGACTTC 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268783 ATTCCATTTTTTGATCCTACTTCTTTTGTTGCGTATGTTGACTTATCCTTTAATGACTTC 33268724 Query 541 TCCGGTGATGTTCCTCTAACATTTGCACAAGAAACAAGGATTTTAGCCTTAGGGGGAAAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268723 TCCGGTGATGTTCCTCTAACATTTGCACAAGAAACAAGGATTTTAGCCTTAGGGGGAAAC 33268664 Query 601 AATTTTTCAGGGAGTTTGAACAGGAACCTGACCAATTTTTACATGCTTGAGCATCTTGAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268663 AATTTTTCAGGGAGTTTGAACAGGAACCTGACCAATTTTTACATGCTTGAGCATCTTGAT 33268604 Query 661 CTTCATGACAACAGACTCACAGGAGAATTCCTAAATTTTATCTCAGAAATGTCCACACTT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268603 CTTCATGACAACAGACTCACAGGAGAATTCCTAAATTTTATCTCAGAAATGTCCACACTT 33268544 Query 721 AGAAGCTTGAATTTGAGGAATATTTTCCTACAAGGTTCAGTTCCTTGTAGCATTTCCAAC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268543 AGAAGCTTGAATTTGAGGAATATTTTCCTACAAGGTTCAGTTCCTTGTAGCATTTCCAAC 33268484 Query 781 TTAAGCAATCTTCAAATACTTGACTTGTCACACAACAGCTTCACTGGAAGCATCCCTTCA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268483 TTAAGCAATCTTCAAATACTTGACTTGTCACACAACAGCTTCACTGGAAGCATCCCTTCA 33268424 Query 841 GAGGTCGGAAATCTAGTTGGAATGATTGAAACGCCAAGTACGTTCTCATCAATATCATTC 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268423 GAGGTCGGAAATCTAGTTGGAATGATTGAAACGCCAAGTACGTTCTCATCAATATCATTC 33268364 Query 901 GTTTTCACCTTCTCAATTGAATACACTGACCTGATAGTGAACTGGAAGAG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268363 GTTTTCACCTTCTCAATTGAATACACTGACCTGATAGTGAACTGGAAGAG 33268314 Score = 693 bits (375), Expect = 0.0 Identities = 375/375 (100%), Gaps = 0/375 (0%) Strand=Plus/Minus Query 949 AGTCTCTCTGGTCCAATACCTCAATCCTTTACAAAGCTTCAACAACTCACAACTCTGGAT 1008 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268101 AGTCTCTCTGGTCCAATACCTCAATCCTTTACAAAGCTTCAACAACTCACAACTCTGGAT 33268042 Query 1009 GTCAGCAATAACCATCTAAAGGGTAAAATCCCAGTTGGTGGCCAAACGGATACAATGGAT 1068 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33268041 GTCAGCAATAACCATCTAAAGGGTAAAATCCCAGTTGGTGGCCAAACGGATACAATGGAT 33267982 Query 1069 GATCCAAATTATTATGCTAATAATAGTGGCCTGTGTGGCTTCCAAATTCAACTGCGGTGT 1128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33267981 GATCCAAATTATTATGCTAATAATAGTGGCCTGTGTGGCTTCCAAATTCAACTGCGGTGT 33267922 Query 1129 CCTGAAAACAAGTCACCACAAGCAATGGAACCCGAGAATGAGAGCGAAGAGCCATGGTTT 1188 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33267921 CCTGAAAACAAGTCACCACAAGCAATGGAACCCGAGAATGAGAGCGAAGAGCCATGGTTT 33267862 Query 1189 GCATGGGAAGCAATGTGGATAGGATTACCATTTGGTTTCCTTGTATCAATTCTAGTCATA 1248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33267861 GCATGGGAAGCAATGTGGATAGGATTACCATTTGGTTTCCTTGTATCAATTCTAGTCATA 33267802 Query 1249 TTTCTTACTGGACTTTTCACCCCCAAGAAGCTTACACAACAGCGTAGCCTCCTAAGAAAG 1308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 33267801 TTTCTTACTGGACTTTTCACCCCCAAGAAGCTTACACAACAGCGTAGCCTCCTAAGAAAG 33267742 Query 1309 CACGCTCGGAACTGA 1323 ||||||||||||||| Sbjct 33267741 CACGCTCGGAACTGA 33267727 >Nbe.v1.1.chr08 Length=143789764 Score = 1583 bits (857), Expect = 0.0 Identities = 919/950 (97%), Gaps = 0/950 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGAAGGCTCTGAAAAATCTGTTTCTTGGAAAATATGCATTGAAATGGAACAACAATGCC 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102014 ATGAAGGCTCTGAAAAATCTGTTTCTTGGAAAAAATGCATTGAAATGGAACAACAATGCC 102073 Query 61 AAGATAGTGCCTCAATGCATGTTATCTGGACTGTCCCTTCAGTCTTGCGGCCTTGTAGGA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102074 AAGATAGTGCCTCAATGCATGTTATCTGGACTGTCCCTTCAGTCTTGCGGCCTTGTAGGA 102133 Query 121 CCTATCCCAGAATGGATTTCTTCACAAAGAAGGATTGATTACTTGGATTTGAGTGATAAG 180 || || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 102134 CCGATACCAGAATGGATTTCTTCACAAACAAGTATTGATTACTTGGATTTGAGTGACAAC 102193 Query 181 AAGCTCATAGGAACTTTCCCCCAGTGGCTAGCAGAAATGGAACTTGGAACTATTATTCTG 240 |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102194 AAGCTCGTAGGAACTTTCCCTCAGTGGCTTGCAGAAATGGAACTTGGAACTATTATTCTG 102253 Query 241 TCAGATAACAATCTAACAGGTTCTCTCCTTCCTAGTCTCTTCCATTCCAGAAGTCTATCT 300 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102254 TCGGATAACAATCTAACAGGTTCTCTCCTTCCTAGTCTCTTCCATTCCAGAAGTCTATCT 102313 Query 301 CTTCTTGACCTTTCAAGAAACAGGTTTTCGGCGGAGCTGCCAGAAAACATGGGTAATGCT 360 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102314 CTTCTTGACCTTTCAAGAAACAGGTTTTCAGGGGAGCTGCCAGAAAACATGGGTAATGCT 102373 Query 361 ACCGCGATTATGATTCTCATATTGGCTGAGAACAGTTGCTCTGGAAAAATTCCAAGCTCC 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| Sbjct 102374 ACCGCGATTATGATTCTCATATTGGCTGAGAACAGTTTCTCTGGAAAAATTCCGAGCTCC 102433 Query 421 ATCACCAACATTTATCGCTTGTTACTGTTGGACTTGTCAAAGAACAGACTTTCCGGCACA 480 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 102434 ATCACCAATATTTATCGCTTGTTACTGTTGGACTTGTCAAAGAACAGACTTTCTGGCACA 102493 Query 481 ATTCCATTTTTTGATCCTACTTCTTTTGTTGCGTATGTTGACTTATCCTTTAATGACTTC 540 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102494 ATTCCATTTTTTGATCCAACTTCTTTTGTTGCATATGTTGACTTATCCTTTAATGACTTC 102553 Query 541 TCCGGTGATGTTCCTCTAACATTTGCACAAGAAACAAGGATTTTAGCCTTAGGGGGAAAC 600 |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 102554 TCCGGTGATGTTCCTCTAACCTTTTCACAAGAAACCAGGATTTTAGCCTTAGGGGGAAAC 102613 Query 601 AATTTTTCAGGGAGTTTGAACAGGAACCTGACCAATTTTTACATGCTTGAGCATCTTGAT 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102614 AATTTTTCAGGGAGTTTGAACAGGAACCTGACCAATTTTTACATGCTTGAGCATCTTGAT 102673 Query 661 CTTCATGACAACAGACTCACAGGAGAATTCCTAAATTTTATCTCAGAAATGTCCACACTT 720 ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102674 CTTCATGACAACAGAATCACAGGAGAATTCCCAAATTTTATCTCAGAAATGTCCACACTT 102733 Query 721 AGAAGCTTGAATTTGAGGAATATTTTCCTACAAGGTTCAGTTCCTTGTAGCATTTCCAAC 780 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102734 AGAAGCTTGAATTTGAGGAATAATTTCCTACAAGGTTCAGTTCCTTGTAGCATTTCCAAC 102793 Query 781 TTAAGCAATCTTCAAATACTTGACTTGTCACACAACAGCTTCACTGGAAGCATCCCTTCA 840 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 102794 TTAAGTAAGCTTCAAATACTTGACTTGTCACACAACAGCTTCTCTGGAAGCATCCCTTCA 102853 Query 841 GAGGTCGGAAATCTAGTTGGAATGATTGAAACGCCAAGTACGTTCTCATCAATATCATTC 900 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 102854 GAGATCGGAAATCTAGTTGGAATGATTGAAACGCCAAGTACGTTCTCATCAATATCATTC 102913 Query 901 GTTTTCACCTTCTCAATTGAATACACTGACCTGATAGTGAACTGGAAGAG 950 || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 102914 GTGTTCACCTTCTCAATTGAATACACTGACCTGCTAGTGAACTGGAAGAG 102963 Score = 610 bits (330), Expect = 6e-172 Identities = 362/378 (96%), Gaps = 0/378 (0%) Strand=Plus/Plus Query 946 AAGAGTCTCTCTGGTCCAATACCTCAATCCTTTACAAAGCTTCAACAACTCACAACTCTG 1005 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 103172 AACAGTCTCTCTGGTCCAATACCTCAATCCTTTACAAAGCTTCAACAACTCACTACTCTG 103231 Query 1006 GATGTCAGCAATAACCATCTAAAGGGTAAAATCCCAGTTGGTGGCCAAACGGATACAATG 1065 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 103232 GATGTCAGCAATAACCATCTAGAGGGTAAAATCCCAGTTGGTGGCCAAATGGATACAATG 103291 Query 1066 GATGATCCAAATTATTATGCTAATAATAGTGGCCTGTGTGGCTTCCAAATTCAACTGCGG 1125 |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 103292 GATGATCCAACTTATTATGCTAATAATAGTGGTCTTTGTGGCTTCCAAATTCAACTGCAC 103351 Query 1126 TGTCCTGAAAACAAGTCACCACAAGCAATGGAACCCGAGAATGAGAGCGAAGAGCCATGG 1185 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| Sbjct 103352 TGTCCTGAAAACAAGTCACCACAAGCAATGGAACCAGAGAATGAGAGCAAAGAGCCATGG 103411 Query 1186 TTTGCATGGGAAGCAATGTGGATAGGATTACCATTTGGTTTCCTTGTATCAATTCTAGTC 1245 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 103412 TTTGCATGGGAAGCAATGTGTATAGGATTCCCATTTGGTTTCCTTGTATCAATTCTAGTC 103471 Query 1246 ATATTTCTTACTGGACTTTTCACCCCCAAGAAGCTTACACAACAGCGTAGCCTCCTAAGA 1305 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 103472 ATATTTCTTACTGGACTTTTCACCCCCAAGAAGCTTACACAACAGCGTAGCCTCCTAAGA 103531 Query 1306 AAGCACGCTCGGAACTGA 1323 | || |||||| |||||| Sbjct 103532 AGGCGCGCTCGCAACTGA 103549 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 3780526128980 Database: Nbe_v1.1_scf Genome Blast Database Posted date: Dec 5, 2024 9:41 AM Number of letters in database: 2,926,155,461 Number of sequences in database: 1,666 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5