BLASTN 2.15.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Nbe_v1.1_scf Genome Blast Database 1,666 sequences; 2,926,155,461 total letters Query= Nbe.v1.1.chr03g18250 Length=1479 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Nbe.v1.1.chr03 933 0.0 >Nbe.v1.1.chr03 Length=132617964 Score = 933 bits (505), Expect = 0.0 Identities = 508/509 (99%), Gaps = 1/509 (0%) Strand=Plus/Plus Query 220 GTGGACTTAACTGGAGGCTATTATGATGCTGGAGACAATGTCAAGTTCAATTTCCCAATG 279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988137 GTGGACTTAACTGGAGGCTATTATGATGCTGGAGACAATGTCAAGTTCAATTTCCCAATG 66988196 Query 280 GCGTACACTACCACAATGCTTTCTTGGAACACACTTGAGTATGGCAAGAGAATGGGCCCC 339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988197 GCGTACACTACCACAATGCTTTCTTGGAACACACTTGAGTATGGCAAGAGAATGGGCCCC 66988256 Query 340 CAATTGCAAAATGCACGGGCCGCTATCCGTTGGGCCACCGATTACTTCCTCAAGTGTGCA 399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988257 CAATTGCAAAATGCACGGGCCGCTATCCGTTGGGCCACCGATTACTTCCTCAAGTGTGCA 66988316 Query 400 AATGCTGCGCCCAACAAGCTCTTCGTTGGCGTTGGTGACCCAAATGCTGATCACAAATGT 459 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988317 AATGCTGCGCCCAACAAGCTCTTCGTTGGCGTTGGTGACCCAAATGCTGATCACAAATGT 66988376 Query 460 TGGGAAAGGCCTGAAGATATGGACACTGCCCGGAGCGTCTATTATGTCTCTCCGAGCAGT 519 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988377 TGGGAAAGGCCTGAAGATATGGACACTGCCCGGAGCGTCTATTATGTCTCTCCGAGCAGT 66988436 Query 520 CCTGGTTCAGACGTGGCCGGAGAAATGGCTGCAGCTTTAGCTGCTGCCTCATTAGTTTTC 579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988437 CCTGGTTCAGACGTGGCCGGAGAAATGGCTGCAGCTTTAGCTGCTGCCTCATTAGTTTTC 66988496 Query 580 CGGACGGTTGATCCGGTTTACTCAAAAAAGCTACTGGGAAATGCAGTGAAAGTATTTAGA 639 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988497 CGGACGGTTGATCCGGTTTACTCAAAAAAGCTACTGGGAAATGCAGTGAAAGTATTTAGA 66988556 Query 640 TTTGCAGTTCAATACAGAGGCTCCTATAGTGATTCACTAGGCTCTGCAGCTTGCCCATTC 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66988557 TTTGCAGTTCAATACAGAGGCTCCTATAGTGATTCACTAGGCTCTGCAGCTTGCCCATTC 66988616 Query 700 TACTGCTCATACTCTGGTTATAAGG-ATG 727 ||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 66988617 TACTGCTCATACTCTGGTTATAAGGTATG 66988645 Score = 614 bits (332), Expect = 5e-173 Identities = 332/332 (100%), Gaps = 0/332 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1148 AGGTGGACTATACATTGGGTAACAATCCAATGAAAATGTCATACATGGTAGGCTATGGAA 1207 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990028 AGGTGGACTATACATTGGGTAACAATCCAATGAAAATGTCATACATGGTAGGCTATGGAA 66990087 Query 1208 CAAATTACCCTCGAAGAGTTCACCACAGAGGATCATCTTTACCTTCAATGGCAATGCATC 1267 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990088 CAAATTACCCTCGAAGAGTTCACCACAGAGGATCATCTTTACCTTCAATGGCAATGCATC 66990147 Query 1268 CACAGTCATTTGGGTGTGATGGTGGATTTCAACCATACTATTATACAGCAAATGCTAACC 1327 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990148 CACAGTCATTTGGGTGTGATGGTGGATTTCAACCATACTATTATACAGCAAATGCTAACC 66990207 Query 1328 CAAACATATTGGTTGGAGCAATTGTTGGAGGACCTAATCAAAATGATTTCTTCCCAGATG 1387 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990208 CAAACATATTGGTTGGAGCAATTGTTGGAGGACCTAATCAAAATGATTTCTTCCCAGATG 66990267 Query 1388 AACGTACAGATTATAGTCATTCAGAGCCTGCTACTTATATTAATGCTGCTATTGTTGGAC 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990268 AACGTACAGATTATAGTCATTCAGAGCCTGCTACTTATATTAATGCTGCTATTGTTGGAC 66990327 Query 1448 CTCTAGCATACTTTGATAGTTCCAAACGTTAG 1479 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66990328 CTCTAGCATACTTTGATAGTTCCAAACGTTAG 66990359 Score = 409 bits (221), Expect = 3e-111 Identities = 221/221 (100%), Gaps = 0/221 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGTTTAGAGTGAAAGTTTCTGTTTGCATCATTCTCTTCTTGTCCTTCTCATCATTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66987282 ATGGCGTTTAGAGTGAAAGTTTCTGTTTGCATCATTCTCTTCTTGTCCTTCTCATCATTC 66987341 Query 61 TTCTTCTCTTTGGGTACTGCCCAAGGAGGTTTCAACTATAGAGAAGCTCTTGAAAAGTCC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66987342 TTCTTCTCTTTGGGTACTGCCCAAGGAGGTTTCAACTATAGAGAAGCTCTTGAAAAGTCC 66987401 Query 121 ATTTTGTTCTTTGAAGGACAAAGATCAGGGAAACTCCCCCCTAACCAGCGGGTCTCTTGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66987402 ATTTTGTTCTTTGAAGGACAAAGATCAGGGAAACTCCCCCCTAACCAGCGGGTCTCTTGG 66987461 Query 181 AGGGGTAGTTCGGGACTTTCAGATGGTTCACTTGCTAAAGT 221 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66987462 AGGGGTAGTTCGGGACTTTCAGATGGTTCACTTGCTAAAGT 66987502 Score = 311 bits (168), Expect = 8e-82 Identities = 168/168 (100%), Gaps = 0/168 (0%) Strand=Plus/Plus Query 984 AGGGGGCCTAATTTACAAGCTACCTGAAGAAAATCTTCAATATGTGACATCAATCACATC 1043 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989677 AGGGGGCCTAATTTACAAGCTACCTGAAGAAAATCTTCAATATGTGACATCAATCACATC 66989736 Query 1044 TTTGCTCACCACTTATGCCAAATATATGGCAAGTAAAAAGCACACTTTCAATTGTGGAAG 1103 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989737 TTTGCTCACCACTTATGCCAAATATATGGCAAGTAAAAAGCACACTTTCAATTGTGGAAG 66989796 Query 1104 CCTCTTGGTCACAGAAAAGGCCATTAGAATACTTGCAAAAAGACAGGT 1151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989797 CCTCTTGGTCACAGAAAAGGCCATTAGAATACTTGCAAAAAGACAGGT 66989844 Score = 281 bits (152), Expect = 6e-73 Identities = 152/152 (100%), Gaps = 0/152 (0%) Strand=Plus/Plus Query 722 AGGATGAACTATATTGGGGAGCTGCGTGGCTATTGAGAGCAACAAATGATATTTCATATT 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989190 AGGATGAACTATATTGGGGAGCTGCGTGGCTATTGAGAGCAACAAATGATATTTCATATT 66989249 Query 782 TAAATTTCATAAACACATTGGGAGCCAATGATGTACCAGACTTATTTAGCTGGGATAACA 841 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989250 TAAATTTCATAAACACATTGGGAGCCAATGATGTACCAGACTTATTTAGCTGGGATAACA 66989309 Query 842 AGTATGCTGGTGCTCATGTTCTTATGGCAAGG 873 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989310 AGTATGCTGGTGCTCATGTTCTTATGGCAAGG 66989341 Score = 211 bits (114), Expect = 8e-52 Identities = 114/114 (100%), Gaps = 0/114 (0%) Strand=Plus/Plus Query 873 GAGAAGCGTTGTTGGAAATGACAAAAGGTTTGATTCATTCAGACAACAGGCTGAAAACTT 932 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989474 GAGAAGCGTTGTTGGAAATGACAAAAGGTTTGATTCATTCAGACAACAGGCTGAAAACTT 66989533 Query 933 TGTTTGCAAAATACTACCCAACTCACCTTATACAAGCACCCAATATACAAAAGG 986 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 66989534 TGTTTGCAAAATACTACCCAACTCACCTTATACAAGCACCCAATATACAAAAGG 66989587 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 4236998324120 Database: Nbe_v1.1_scf Genome Blast Database Posted date: Dec 5, 2024 9:41 AM Number of letters in database: 2,926,155,461 Number of sequences in database: 1,666 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5