BLASTN 2.15.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Niben101 cDNA Blast Database 57,140 sequences; 82,582,885 total letters Query= Nbe.v1.1.chr03g18250 Length=1479 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Niben101Scf01184g16001.1 2732 0.0 >Niben101Scf01184g16001.1 Length=1875 Score = 2732 bits (1479), Expect = 0.0 Identities = 1479/1479 (100%), Gaps = 0/1479 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGTTTAGAGTGAAAGTTTCTGTTTGCATCATTCTCTTCTTGTCCTTCTCATCATTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 155 ATGGCGTTTAGAGTGAAAGTTTCTGTTTGCATCATTCTCTTCTTGTCCTTCTCATCATTC 214 Query 61 TTCTTCTCTTTGGGTACTGCCCAAGGAGGTTTCAACTATAGAGAAGCTCTTGAAAAGTCC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 215 TTCTTCTCTTTGGGTACTGCCCAAGGAGGTTTCAACTATAGAGAAGCTCTTGAAAAGTCC 274 Query 121 ATTTTGTTCTTTGAAGGACAAAGATCAGGGAAACTCCCCCCTAACCAGCGGGTCTCTTGG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 275 ATTTTGTTCTTTGAAGGACAAAGATCAGGGAAACTCCCCCCTAACCAGCGGGTCTCTTGG 334 Query 181 AGGGGTAGTTCGGGACTTTCAGATGGTTCACTTGCTAAAGTGGACTTAACTGGAGGCTAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 335 AGGGGTAGTTCGGGACTTTCAGATGGTTCACTTGCTAAAGTGGACTTAACTGGAGGCTAT 394 Query 241 TATGATGCTGGAGACAATGTCAAGTTCAATTTCCCAATGGCGTACACTACCACAATGCTT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 395 TATGATGCTGGAGACAATGTCAAGTTCAATTTCCCAATGGCGTACACTACCACAATGCTT 454 Query 301 TCTTGGAACACACTTGAGTATGGCAAGAGAATGGGCCCCCAATTGCAAAATGCACGGGCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 455 TCTTGGAACACACTTGAGTATGGCAAGAGAATGGGCCCCCAATTGCAAAATGCACGGGCC 514 Query 361 GCTATCCGTTGGGCCACCGATTACTTCCTCAAGTGTGCAAATGCTGCGCCCAACAAGCTC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 515 GCTATCCGTTGGGCCACCGATTACTTCCTCAAGTGTGCAAATGCTGCGCCCAACAAGCTC 574 Query 421 TTCGTTGGCGTTGGTGACCCAAATGCTGATCACAAATGTTGGGAAAGGCCTGAAGATATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 575 TTCGTTGGCGTTGGTGACCCAAATGCTGATCACAAATGTTGGGAAAGGCCTGAAGATATG 634 Query 481 GACACTGCCCGGAGCGTCTATTATGTCTCTCCGAGCAGTCCTGGTTCAGACGTGGCCGGA 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 635 GACACTGCCCGGAGCGTCTATTATGTCTCTCCGAGCAGTCCTGGTTCAGACGTGGCCGGA 694 Query 541 GAAATGGCTGCAGCTTTAGCTGCTGCCTCATTAGTTTTCCGGACGGTTGATCCGGTTTAC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 695 GAAATGGCTGCAGCTTTAGCTGCTGCCTCATTAGTTTTCCGGACGGTTGATCCGGTTTAC 754 Query 601 TCAAAAAAGCTACTGGGAAATGCAGTGAAAGTATTTAGATTTGCAGTTCAATACAGAGGC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 755 TCAAAAAAGCTACTGGGAAATGCAGTGAAAGTATTTAGATTTGCAGTTCAATACAGAGGC 814 Query 661 TCCTATAGTGATTCACTAGGCTCTGCAGCTTGCCCATTCTACTGCTCATACTCTGGTTAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 815 TCCTATAGTGATTCACTAGGCTCTGCAGCTTGCCCATTCTACTGCTCATACTCTGGTTAT 874 Query 721 AAGGATGAACTATATTGGGGAGCTGCGTGGCTATTGAGAGCAACAAATGATATTTCATAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 875 AAGGATGAACTATATTGGGGAGCTGCGTGGCTATTGAGAGCAACAAATGATATTTCATAT 934 Query 781 TTAAATTTCATAAACACATTGGGAGCCAATGATGTACCAGACTTATTTAGCTGGGATAAC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 935 TTAAATTTCATAAACACATTGGGAGCCAATGATGTACCAGACTTATTTAGCTGGGATAAC 994 Query 841 AAGTATGCTGGTGCTCATGTTCTTATGGCAAGGAGAAGCGTTGTTGGAAATGACAAAAGG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 995 AAGTATGCTGGTGCTCATGTTCTTATGGCAAGGAGAAGCGTTGTTGGAAATGACAAAAGG 1054 Query 901 TTTGATTCATTCAGACAACAGGCTGAAAACTTTGTTTGCAAAATACTACCCAACTCACCT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1055 TTTGATTCATTCAGACAACAGGCTGAAAACTTTGTTTGCAAAATACTACCCAACTCACCT 1114 Query 961 TATACAAGCACCCAATATACAAAAGGGGGCCTAATTTACAAGCTACCTGAAGAAAATCTT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1115 TATACAAGCACCCAATATACAAAAGGGGGCCTAATTTACAAGCTACCTGAAGAAAATCTT 1174 Query 1021 CAATATGTGACATCAATCACATCTTTGCTCACCACTTATGCCAAATATATGGCAAGTAAA 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1175 CAATATGTGACATCAATCACATCTTTGCTCACCACTTATGCCAAATATATGGCAAGTAAA 1234 Query 1081 AAGCACACTTTCAATTGTGGAAGCCTCTTGGTCACAGAAAAGGCCATTAGAATACTTGCA 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1235 AAGCACACTTTCAATTGTGGAAGCCTCTTGGTCACAGAAAAGGCCATTAGAATACTTGCA 1294 Query 1141 AAAAGACAGGTGGACTATACATTGGGTAACAATCCAATGAAAATGTCATACATGGTAGGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1295 AAAAGACAGGTGGACTATACATTGGGTAACAATCCAATGAAAATGTCATACATGGTAGGC 1354 Query 1201 TATGGAACAAATTACCCTCGAAGAGTTCACCACAGAGGATCATCTTTACCTTCAATGGCA 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1355 TATGGAACAAATTACCCTCGAAGAGTTCACCACAGAGGATCATCTTTACCTTCAATGGCA 1414 Query 1261 ATGCATCCACAGTCATTTGGGTGTGATGGTGGATTTCAACCATACTATTATACAGCAAAT 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1415 ATGCATCCACAGTCATTTGGGTGTGATGGTGGATTTCAACCATACTATTATACAGCAAAT 1474 Query 1321 GCTAACCCAAACATATTGGTTGGAGCAATTGTTGGAGGACCTAATCAAAATGATTTCTTC 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1475 GCTAACCCAAACATATTGGTTGGAGCAATTGTTGGAGGACCTAATCAAAATGATTTCTTC 1534 Query 1381 CCAGATGAACGTACAGATTATAGTCATTCAGAGCCTGCTACTTATATTAATGCTGCTATT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1535 CCAGATGAACGTACAGATTATAGTCATTCAGAGCCTGCTACTTATATTAATGCTGCTATT 1594 Query 1441 GTTGGACCTCTAGCATACTTTGATAGTTCCAAACGTTAG 1479 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1595 GTTGGACCTCTAGCATACTTTGATAGTTCCAAACGTTAG 1633 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 117834296985 Database: Niben101 cDNA Blast Database Posted date: Dec 5, 2024 9:47 AM Number of letters in database: 82,582,885 Number of sequences in database: 57,140 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5