BLASTN 2.15.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Niben101 cDNA Blast Database 57,140 sequences; 82,582,885 total letters Query= Nbe.v1.1.chr12g27500 Length=1602 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Niben101Scf12469g00012.1 2667 0.0 Niben101Ctg14374g00002.1 1917 0.0 Niben101Scf05245g03003.1 1269 0.0 >Niben101Scf12469g00012.1 Length=2736 Score = 2667 bits (1444), Expect = 0.0 Identities = 1552/1605 (97%), Gaps = 3/1605 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAAGAACAAATAGTTCATGGTGATGGGTTATTGGTGAATTTAGCAAATGAAGTGAAA 60 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 569 ATGGAAGAACAAATTGTTCATGGTGATGGGTTATTGGTGAATTTAGCAAATGAAGTGAAA 628 Query 61 TTAGAAGAAGATGAGGAAGATTTTTGCAGCTGTTGTGAAGATGAGGAGGAATTGGAGGAA 120 |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| Sbjct 629 TTAGAAGAAGATGAGGAAGATTTTTGTAGCTGCTGTGAAGATGAGGAGGAGTTGGGGGAA 688 Query 121 GCAGCTTTGAAGGAAGAAGAGGATGAAGTAACAA---AGGAGAAGGAATTATTGGTAAGT 177 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| Sbjct 689 ACAGCTTTGAAGGAAGAAGAGGATGAAGTAACAAAGGAGGAGAAGGAGTTATTAGTGAGT 748 Query 178 GAAAGTTGTGAGGTAGATCTTGATGAACATTCAATTAAATTGTTCTTTAAAGGGATTTCT 237 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 749 GAAAGTTGTGAGGTAGATCTTGATGAACGTTCAATTAAATTGTTCTTTAAAGGGATTTCT 808 Query 238 ATAGCTGGTCCTGGAGATTCTGGTTGTAGAATATCAGGAATTGGAGTGGTTATGGAGAGG 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 809 ATAGCTGGTCCTGGAGATTCTGGTTGTAGAATATCAGGAATTGGAGTGGTTATGGAGAGG 868 Query 298 GCAGAAAGTGTTTCTCCTATTCAAATCCAGAAGAAGCTTGATTTCTATGTGGAAGAATTT 357 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 869 GCAGAGAGTGTTTCTCCTATTCAAATCCAGAAGAAGCTTGATTTCTATGTGGAAGAATTT 928 Query 358 GTGGCAGATTATTTGGCTTTGATGGATGGATTGTTGGAAGCTGTGAAAAACAAGATTAGA 417 ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | Sbjct 929 GTGGCAGATTATTTGGCCTTGATGGATGGACTGTTGGAAGCTGTGAAGAACAAGATTACA 988 Query 418 AAAGTTTATGCCTTTACTGACTCTGAGATATTATATCAGCAGATTATGCATGAAGAGAGC 477 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | Sbjct 989 AAAGTCTATGCCTTTACTGACTCTGAGATATTATATCTGCAGATTATGCACGAAGAGATC 1048 Query 478 CTTGATAATCCGCTTCTCATGGCATTGCGACAAAGGATTCTGGATCATGCTGATGATCTG 537 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 1049 CTTGATAATCCGCTTCTCATGGCATTGCGACAAAGGATTCTTGATCATGTTGATGATCTG 1108 Query 538 GAGGCTTTTGTTCTGAAGCTTGTCCCAAGTACTGGTCTGGCAAAGGCGTTGGACTTGGCG 597 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1109 GAGGCTTTTGTTCTGAAGCTTGTTCCAAGTACTGGTCTGGCAAAGGCGTTGGACTTGGCG 1168 Query 598 AAAGTAGCAATAGGTATTGTCTCTTCCCATCTTGAAGGAGATGAATCAACTGAGAATTGT 657 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1169 AAAGTAGCAATAGGGATTGTCTCTTCCCATCTTGAAGGAGATGAATCAACTGAGAATTGT 1228 Query 658 CCAATATGCTGCGAGGATAGACTGTTACTGATGATGAGCACATTAAAGTGTACCCACAAA 717 ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1229 CCAATATGCTGTGAGGATAGACTATTACTAATGATGAGCACATTAAAATGTACCCACAAA 1288 Query 718 TTCTGTTCTCACTGCATGAGAACTTATGTTGAGGGTAAAGTTCAATCTGGTCAAGTCCCC 777 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1289 TTCTGTTCTCACTGCATGAGAACTTATGTTGAGGGTAAAGTTCAATCTGGTCAAGTCCCC 1348 Query 778 ATTAGGTGCCCGCAGCTAAAATGCAAGTACTTAATCTCTGCTACTGAATGTATATCTTTT 837 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1349 ATTAGATGCCCTCAGCTAAAATGCAAGTACTTAATCTCTGCTACTGAATGTATATCTTTT 1408 Query 838 CTCCCGCTTAACTCCTATGAATCTTTGGTGAGAGCTCTTGAAGAAGCAAATGCTCTCAAC 897 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1409 CTCCCGCTTAACTCCTATGAATCTTTGGCGAGAGCTCTTGAAGAAGCAAATGCTCTCAAC 1468 Query 898 TCGGACAAACATTACTGCCCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGT 957 |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1469 TCGGACAAGCTTTACTGTCCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGT 1528 Query 958 TTGTCAACTCGGGCTAGTTCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTT 1017 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1529 TTGTCAACTCGTGCTAGTTCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTT 1588 Query 1018 TGTCAGAGGTTCATGTGTGTGGATTGTCGGGTTCCATGGCATTCTTCAATGACATGTGAA 1077 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1589 TGTCAGAGGTTCATGTGTGTGGATTGTCGGGTTCCATGGCATTCTTCAATGACATGTGAA 1648 Query 1078 GTCTACCAAAATCTCCCTTTGGAGGAGAGGGAAGCTGGCGACATAACTTTGCATCGCCTG 1137 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1649 GTCTACCAAAATCTCCCTTTGGAGGAGAGGGAAGCCGGCGACATAACTTTGCATCGCCTG 1708 Query 1138 GCACAGAATAAAAGATGGAGGCGCTGTTCACAATGCCGGAGGATGATTGAGCTCGCACGT 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1709 GCACAGAATAAAAGATGGAGGCGCTGTTCACAGTGCCGGAGGATGATTGAGCTCGCACAT 1768 Query 1198 GGATGCTATCATATGACGTGCTGGTGCGGGCATGAATTCTGTTATTCTTGTGGTGCGGAA 1257 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1769 GGATGCTATCATATGACGTGCTGGTGTGGGCATGAATTCTGTTATTCTTGTGGTGCGGAA 1828 Query 1258 TGCAGGGAGAGCCAACAGGCTTGTCAATGTGCATTCTGGGATGAGGATTATACTCAAGAT 1317 | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1829 TACAGGGACAGCCAACAGACTTGTCAATGTGCATTTTGGGATGAGCATTATACTCAAGAT 1888 Query 1318 TTGGTAACTCAACCGGCGCAGCAGTTTGAGCAATGGGCGTGGGACTCATTCGAGTCGCTG 1377 |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1889 TTGGCAACTCAACCGACGCAGCAGTTTGAGCAATGGGCGTGGGACTCATTCGGGTCGCTG 1948 Query 1378 CCTATGATGATGGATGCATATTCAGATGAAGAGAGATCTCAGCTGGCTTTGATCCAGAGA 1437 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1949 CCTATGATGATGGATGCATATTCAGATGAAGAGAGATCTCAGCTGGCTTTGATCCAGAGA 2008 Query 1438 TTTCTTGCTGGCGGATTCAGTCTAACGGACCACCAAGCTTACCAATCCCCGCCACGTTGT 1497 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2009 TTTCTTGCTGGTGGATTCAGTCTAACGGACCACCAAGCTTACCAATCCCCGCCACGTTGT 2068 Query 1498 ACAGATTCTTATGTTGATGCCATGAAAGATCTCCATCAGCTTCCATGGCTCGAACAATTT 1557 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2069 ACAGATTCTTATGTTGATGCCATGAAGGATCTCCATCAGCTTCCATGGCTCGAACGATTT 2128 Query 1558 GTGTCTGTGATAAGCGACAATTACTACGAAGAACATATCCAGTGA 1602 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2129 GTGTCCGTGATAAGCGACAATTACTACGAAGAACATATCCAGTGA 2173 >Niben101Ctg14374g00002.1 Length=1640 Score = 1917 bits (1038), Expect = 0.0 Identities = 1038/1038 (100%), Gaps = 0/1038 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAAGAACAAATAGTTCATGGTGATGGGTTATTGGTGAATTTAGCAAATGAAGTGAAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 603 ATGGAAGAACAAATAGTTCATGGTGATGGGTTATTGGTGAATTTAGCAAATGAAGTGAAA 662 Query 61 TTAGAAGAAGATGAGGAAGATTTTTGCAGCTGTTGTGAAGATGAGGAGGAATTGGAGGAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 663 TTAGAAGAAGATGAGGAAGATTTTTGCAGCTGTTGTGAAGATGAGGAGGAATTGGAGGAA 722 Query 121 GCAGCTTTGAAGGAAGAAGAGGATGAAGTAACAAAGGAGAAGGAATTATTGGTAAGTGAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 723 GCAGCTTTGAAGGAAGAAGAGGATGAAGTAACAAAGGAGAAGGAATTATTGGTAAGTGAA 782 Query 181 AGTTGTGAGGTAGATCTTGATGAACATTCAATTAAATTGTTCTTTAAAGGGATTTCTATA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 783 AGTTGTGAGGTAGATCTTGATGAACATTCAATTAAATTGTTCTTTAAAGGGATTTCTATA 842 Query 241 GCTGGTCCTGGAGATTCTGGTTGTAGAATATCAGGAATTGGAGTGGTTATGGAGAGGGCA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 843 GCTGGTCCTGGAGATTCTGGTTGTAGAATATCAGGAATTGGAGTGGTTATGGAGAGGGCA 902 Query 301 GAAAGTGTTTCTCCTATTCAAATCCAGAAGAAGCTTGATTTCTATGTGGAAGAATTTGTG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 903 GAAAGTGTTTCTCCTATTCAAATCCAGAAGAAGCTTGATTTCTATGTGGAAGAATTTGTG 962 Query 361 GCAGATTATTTGGCTTTGATGGATGGATTGTTGGAAGCTGTGAAAAACAAGATTAGAAAA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 963 GCAGATTATTTGGCTTTGATGGATGGATTGTTGGAAGCTGTGAAAAACAAGATTAGAAAA 1022 Query 421 GTTTATGCCTTTACTGACTCTGAGATATTATATCAGCAGATTATGCATGAAGAGAGCCTT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1023 GTTTATGCCTTTACTGACTCTGAGATATTATATCAGCAGATTATGCATGAAGAGAGCCTT 1082 Query 481 GATAATCCGCTTCTCATGGCATTGCGACAAAGGATTCTGGATCATGCTGATGATCTGGAG 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1083 GATAATCCGCTTCTCATGGCATTGCGACAAAGGATTCTGGATCATGCTGATGATCTGGAG 1142 Query 541 GCTTTTGTTCTGAAGCTTGTCCCAAGTACTGGTCTGGCAAAGGCGTTGGACTTGGCGAAA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1143 GCTTTTGTTCTGAAGCTTGTCCCAAGTACTGGTCTGGCAAAGGCGTTGGACTTGGCGAAA 1202 Query 601 GTAGCAATAGGTATTGTCTCTTCCCATCTTGAAGGAGATGAATCAACTGAGAATTGTCCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1203 GTAGCAATAGGTATTGTCTCTTCCCATCTTGAAGGAGATGAATCAACTGAGAATTGTCCA 1262 Query 661 ATATGCTGCGAGGATAGACTGTTACTGATGATGAGCACATTAAAGTGTACCCACAAATTC 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1263 ATATGCTGCGAGGATAGACTGTTACTGATGATGAGCACATTAAAGTGTACCCACAAATTC 1322 Query 721 TGTTCTCACTGCATGAGAACTTATGTTGAGGGTAAAGTTCAATCTGGTCAAGTCCCCATT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1323 TGTTCTCACTGCATGAGAACTTATGTTGAGGGTAAAGTTCAATCTGGTCAAGTCCCCATT 1382 Query 781 AGGTGCCCGCAGCTAAAATGCAAGTACTTAATCTCTGCTACTGAATGTATATCTTTTCTC 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1383 AGGTGCCCGCAGCTAAAATGCAAGTACTTAATCTCTGCTACTGAATGTATATCTTTTCTC 1442 Query 841 CCGCTTAACTCCTATGAATCTTTGGTGAGAGCTCTTGAAGAAGCAAATGCTCTCAACTCG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1443 CCGCTTAACTCCTATGAATCTTTGGTGAGAGCTCTTGAAGAAGCAAATGCTCTCAACTCG 1502 Query 901 GACAAACATTACTGCCCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGTTTG 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1503 GACAAACATTACTGCCCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGTTTG 1562 Query 961 TCAACTCGGGCTAGTTCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTTTGT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1563 TCAACTCGGGCTAGTTCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTTTGT 1622 Query 1021 CAGAGGTTCATGTGTGTG 1038 |||||||||||||||||| Sbjct 1623 CAGAGGTTCATGTGTGTG 1640 >Niben101Scf05245g03003.1 Length=1247 Score = 1269 bits (687), Expect = 0.0 Identities = 687/687 (100%), Gaps = 0/687 (0%) Strand=Plus/Plus Query 916 CCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGTTTGTCAACTCGGGCTAGT 975 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CCCTATCCAAATTGTTCTGTTCTTTTGGATCCTCATGAATGTTTGTCAACTCGGGCTAGT 60 Query 976 TCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTTTGTCAGAGGTTCATGTGT 1035 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCATCAAGCCAGTCAGAGGATAGTTGTGTGGAATGCCCAGTTTGTCAGAGGTTCATGTGT 120 Query 1036 GTGGATTGTCGGGTTCCATGGCATTCTTCAATGACATGTGAAGTCTACCAAAATCTCCCT 1095 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 GTGGATTGTCGGGTTCCATGGCATTCTTCAATGACATGTGAAGTCTACCAAAATCTCCCT 180 Query 1096 TTGGAGGAGAGGGAAGCTGGCGACATAACTTTGCATCGCCTGGCACAGAATAAAAGATGG 1155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGGAGGAGAGGGAAGCTGGCGACATAACTTTGCATCGCCTGGCACAGAATAAAAGATGG 240 Query 1156 AGGCGCTGTTCACAATGCCGGAGGATGATTGAGCTCGCACGTGGATGCTATCATATGACG 1215 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGGCGCTGTTCACAATGCCGGAGGATGATTGAGCTCGCACGTGGATGCTATCATATGACG 300 Query 1216 TGCTGGTGCGGGCATGAATTCTGTTATTCTTGTGGTGCGGAATGCAGGGAGAGCCAACAG 1275 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TGCTGGTGCGGGCATGAATTCTGTTATTCTTGTGGTGCGGAATGCAGGGAGAGCCAACAG 360 Query 1276 GCTTGTCAATGTGCATTCTGGGATGAGGATTATACTCAAGATTTGGTAACTCAACCGGCG 1335 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GCTTGTCAATGTGCATTCTGGGATGAGGATTATACTCAAGATTTGGTAACTCAACCGGCG 420 Query 1336 CAGCAGTTTGAGCAATGGGCGTGGGACTCATTCGAGTCGCTGCCTATGATGATGGATGCA 1395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CAGCAGTTTGAGCAATGGGCGTGGGACTCATTCGAGTCGCTGCCTATGATGATGGATGCA 480 Query 1396 TATTCAGATGAAGAGAGATCTCAGCTGGCTTTGATCCAGAGATTTCTTGCTGGCGGATTC 1455 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TATTCAGATGAAGAGAGATCTCAGCTGGCTTTGATCCAGAGATTTCTTGCTGGCGGATTC 540 Query 1456 AGTCTAACGGACCACCAAGCTTACCAATCCCCGCCACGTTGTACAGATTCTTATGTTGAT 1515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 AGTCTAACGGACCACCAAGCTTACCAATCCCCGCCACGTTGTACAGATTCTTATGTTGAT 600 Query 1516 GCCATGAAAGATCTCCATCAGCTTCCATGGCTCGAACAATTTGTGTCTGTGATAAGCGAC 1575 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GCCATGAAAGATCTCCATCAGCTTCCATGGCTCGAACAATTTGTGTCTGTGATAAGCGAC 660 Query 1576 AATTACTACGAAGAACATATCCAGTGA 1602 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AATTACTACGAAGAACATATCCAGTGA 687 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 127638165375 Database: Niben101 cDNA Blast Database Posted date: Dec 5, 2024 9:47 AM Number of letters in database: 82,582,885 Number of sequences in database: 57,140 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5